U bassu rapportu di A260 / A230 hè generalmente causatu da impurità cù a lunghezza d'onda massima di assorbimentu à 230nm.Videmu ciò chì includenu queste impurità:
-
Inquinanti cumuni
Lunghezza d'onda di assorbimentu
Effettu di ratio
Proteina
~ 230 nm è 280 nm
Riduzzione simultanea di A260/A 280è A260/A 280ratios
Sal di guanidina
220-240 nm
Riduce l'A260/A 280ratio
Fenol
~ 270 nm
-
Trizol
~ 230 nm è 270 nm
Riduce l'A260/A 280ratio
EDTA
~ 230 nm
Riduce l'A260/A 280ratio
Etanolu
230-240 nm
Riduce l'A260/A 280ratio
Lunghezza d'onda di assorbimentu è valore di cuntrastu di i contaminanti cumuni
Pcontaminazione da roteina
A contaminazione di a proteina pò esse cunsiderata cum'è a contaminazione più cumuna in u prucessu di estrazione di l'acidu nucleicu.A proteina esiste trà a fase aquosa superiore è a fase inferioreorganicufase.A contaminazione riducerà u rapportu di A260 / A280 è A260 / A230 à u stessu tempu, è u rapportu di A260 / A230 cambierà più ovviamente di u rapportu di A260 / A280.
Duranti doputrascrizzione inversaor Reazioni qPCR, I residui di proteini ponu inibisce o interferiscenu cù a funzione enzimatica.U megliu modu per evità a contaminazione di a proteina hè di mantene in mente u principiu di "piuttostu menu di più, una piccula quantità parechje volte" quandu aspira u supernatant.
2. A contaminazione di Guanidinium
hydrochloride (GuHCl) è guanidine thiocyanate (GTC) anu l'effettu di prutezione di denaturazione, chì ponu rapidamente distrughjenu e membrani cellulari durante u prucessu di estrazione di l'acidu nucleicu, causannu a denaturazione di a proteina è a precipitazione.La lunghezza d'onda di assorbimento di GuHCl e GTC è compresa tra 220-240 nm, eU salinu di guanidinium residuale riducerà u rapportu di A260 / A230.Ancu se u salitu di guanidinium residuale riduce u rapportu,l'impattu nantu à esperimenti downstream hè veramente insignificante.
3. A contaminazione di Trizol
U cumpunente principale di Trizol hè fenol.A funzione principale di u fenol hè di lisà e cellule è liberà proteine è sustanzi di l'acidu nucleicu in e cellule.Ancu se u fenol pò denature in modu efficace e proteine , ùn pò micca inibisce completamente l'attività RNase.Dunque, 8-hydroxyquinoline, guanidine isothiocyanate, β-mercaptoethanol, etc. sò aghjuntu à TRIzol per inibisce a RNase endogena è esogena.
Quandu l'estrazione di RNA cellulare, Trizol pò lisà rapidamente e cellule è inibisce a nuclease liberata da e cellule, è u Trizol residuale riduce significativamente a ratio di A260 / A230.
Metudu di trasfurmazioni: Quandu si centrifuga, deve esse nutatu chì u fenol in Trizol hè facilmente solubile in a fase di l'acqua sottu a cundizione di 4 ° è a temperatura di l'ambienti.
4. Residu di etanolu
L'etanol hè utilizatu in u prucessu finali per precipitate l'ADN mentre dissolve l'ioni di sali chì ponu esse ligati à l'ADN.A lunghezza d'onda di assorbimentu di a più altapiccu di assorbimentu dietanolu hè ancu à 230-240 nm, chìriducerà ancu a ratio di A260 / A230.
U metudu di evitari u residu di etanolu pò esse ripetutu duie volte durante l'eluzione finale, soffiendu in ucappa di fumeper dui minuti per permette à l'etanol di evaporà cumplettamente prima di aghjunghje un tampone per l'eluzione.
Tuttavia, deve esse cunnisciutu chì u rapportu hè solu un indice di valutazione di a qualità di l'ARN.Se l'operazioni sopra citate sò strettamente regulate, a deviazione trà u rapportu è a gamma standard ùn avarà micca un grande impattu in l'esperimenti downstream.
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Tempu di Postu: Feb-10-2023